Международная группа исследователей, в составе которой есть учёные из России, обнаружила в человеческих фекалиях 79 кандидатов на новые антибиотики.
Это получилось благодаря новому вычислительному методу для поиска циклопептидов. Так называют класс веществ, в который входят многие известные антибиотики. На сегодняшний день обнаружено около 1200 циклопептидов, первым из них был грамицидин С, открытый советскими учёными. Найти такие вещества довольно трудно из-за их структуры. Однако новый алгоритмический подход CycloNovo позволяет выявлять сотни циклопептидов.
Подход основан на работе масс-спектрометров, так называемых “молекулярных весов», разбивающих молекулы на фрагменты и измеряющих их массу.
Как отмечают учёные, использовать CycloNovo смогут даже специалисты с минимальным уровнем компьютерной грамотности. Программа запускается в пару кликов мыши, а результаты работы показывается в браузере.
Источник: Ferra