Папоротники известны тем, что содержат огромное количество ДНК и чрезмерно большое число хромосом. Две работы, опубликованные в журнале Nature Plants представляют первые полноразмерные геномы гомоспоровых папоротников – большой группы, которая содержит 99% всего современного разнообразия папоротников.
Вопреки всем ожиданиям, небольшой папоротник в настоящее время удерживает титул организма с самым большим количеством хромосом: в каждом его ядре помещается 720 пар. Эта склонность папоротников к накоплению ДНК ставила ученых в тупик, а непостижимый размер их геномов затруднял их последовательность, сборку и интерпретацию.
“Папоротники – ближайшие живые родственники всех семенных растений, и они производят химические средства отпугивания травоядных, которые могут быть полезны для сельскохозяйственных исследований”, – говорит соавтор исследования Дуг Солтис, заслуженный профессор Музея естественной истории Флориды
Анализ генома Ceratopteris дал подсказки для решения давней загадки, почему папоротники в среднем сохраняют больше ДНК, чем другие растения. Сравнение с геномами других групп также привело к неожиданному открытию – папоротники украли у бактерий гены для нескольких своих антитравоядных токсинов.
Секвенирование большого и сложного генома Ceratopteris потребовало более восьми лет работы и совместных усилий десятков исследователей из 28 учреждений по всему миру. Конечным результатом стало 7,46 гигабаз ДНК, что более чем в два раза превышает размер генома человека.
Авторы говорят, что это лишь первый шаг в длинной серии исследований, имеющих практическое применение – от разработки новых биопестицидов до инновационных стратегий сохранения природы.
Источник: Ferra